@thesis{thesis, author={Djajanto Ribka}, title ={Docking protein argonaute dengan siRNA termodifikasi. [CD-ROM]}, year={2013}, url={http://repository.wima.ac.id/id/eprint/90/}, abstract={Terapi gen adalah teknik pengobatan terhadap suatu penyakit melalui transfer bahan genetik ke tubuh pasien yaitu dengan mencegah diekspresikannya gen-gen yang abnormal atau dikenal dengan istilah gene silencing. Terapi gen mereparasi mRNA (messenger RNA) pada tahap translasi mRNA yang dikenal dengan istilah small interfering RNA (siRNA) atau RNA interference (RNAi). Penelitian sebelumnya telah mempelajari dupleks siRNA dan siRNA termodifikasi dengan simulasi dinamika molekul. Dalam penelitian ini dilakukan docking protein Argonaute (Ago) dengan siRNA dan empat siRNA termodifikasi yaitu satu modifikasi gugus ribosa, satu modifikasi pada closing base pair, dan dua modifikasi untaian basa dengan menggunakan program AutoDock dan FlexX. Pengamatan dilakukan pada posisi, afinitas ikatan, dan sifat struktural tersebut, yaitu parameter RMSD, ikatan hidrogen, dan jari-jari girasinya. Hasil interaksi docking modifikasi siRNA pasangan basa untaian C-G dengan protein argonaute memiliki afinitas yang lebih besar berdasarkan hasil docking baik dengan menggunakan AutoDock maupun FlexX.} }