STUDI IN SILICO SENYAWA YANG TERKANDUNG DALAM
DAUN KELOR (Moringae oleifera F) YANG BERPOTENSI SEBAGAI ANTI SARS-CoV-2
Total View This Week0
Total View This Week0
Institusion
UNIVERSITAS BAKTI TUNAS HUSADA
Author
JULIAN, RAHMAT
Subject
S1-Skripsi Farmasi
Datestamp
2022-09-30 07:20:11
Abstract :
ABSTRAK SARS-CoV-2 adalah virus RNA untai positif yang berdiameter mulai dari 60 nm sampai 140 nm yang dapat menginfeksi semua orang. Daun kelor merupakan tanaman yang memiliki aktivitas sebagai pengobatan. Tujuan dari penelitian untuk mengetahui aktivitas senyawa antivirus serta mengetahui senyawa metabolit daun kelor manakah yang lebih baik dan stabil pada reseptor Sars-CoV-2 main protease sebagai agen anti virus. Metode yang digunakan ialah, studi komputasi dengan molekular docking, Uji pkCSM dan simulasi molekular dinamik serta prediksi sintesis dari senyawa. Hasil studi komputasi molekular docking dari 29 senyawa daun kelor didapatkan tiga senyawa terbaik dari hasil docking pada reseptor Main protease senyawa 4-O-alpha-L-Rhamnopyranosylglucosinalbin terbaik pada reseptor 5R7Y, 7JKV, 7VH8, senyawa 4-(4-asetilrhamnosida) pada reseptor 7TLL dengan nilai energi bebas yang rendah. Dari pengujian pkCSM dari 29 senyawa terdapat 3 senyawa yang dipilih memiliki adsorbsi dan distribusi yang baik dan prediksi toksisitas menunjukkan bahwa ada satu senyawa yang tidak memiliki hepatoksisitas. Hasil molekular dinamik pada senyawa 4-O-alpha-L-Rhamnopyranosylglucosinalbin dan senyawa 4-(4-asetilrhamnosida) selama 10 ns menunjukan nilai RMSD dan RMSF yang rendah dan stabil dibandingkan senyawa pada reseptor reseptor main protease Sars-CoV-2. Dari hasil uji prediksi sintesis senyawa daun kelor, senyawa 4-O-alpha-L-Rhamnopyranosylglucosinalbin dan senyawa 4-(4-asetilrhamnosida dapat di sintesis dengan melihat alur pembuatan dari kemiripan senyawa. diketahui bahwa senyawa yang terkandung dalam daun kelor dapat dijadikan kandidat berpotensi dengan afinitas dan kestabilan yang lebih baik. Kata Kunci : Studi komputasi, Docking, Covid-19, Daun kelor, Reseptor. OLEH : RAHMAT JULIAN 31118130
ABSTRAK SARS-CoV-2 adalah virus RNA untai positif yang berdiameter mulai dari 60 nm sampai 140 nm yang dapat menginfeksi semua orang. Daun kelor merupakan tanaman yang memiliki aktivitas sebagai pengobatan. Tujuan dari penelitian untuk mengetahui aktivitas senyawa antivirus serta mengetahui senyawa metabolit daun kelor manakah yang lebih baik dan stabil pada reseptor Sars-CoV-2 main protease sebagai agen anti virus. Metode yang digunakan ialah, studi komputasi dengan molekular docking, Uji pkCSM dan simulasi molekular dinamik serta prediksi sintesis dari senyawa. Hasil studi komputasi molekular docking dari 29 senyawa daun kelor didapatkan tiga senyawa terbaik dari hasil docking pada reseptor Main protease senyawa 4-O-alpha-L-Rhamnopyranosylglucosinalbin terbaik pada reseptor 5R7Y, 7JKV, 7VH8, senyawa 4-(4-asetilrhamnosida) pada reseptor 7TLL dengan nilai energi bebas yang rendah. Dari pengujian pkCSM dari 29 senyawa terdapat 3 senyawa yang dipilih memiliki adsorbsi dan distribusi yang baik dan prediksi toksisitas menunjukkan bahwa ada satu senyawa yang tidak memiliki hepatoksisitas. Hasil molekular dinamik pada senyawa 4-O-alpha-L-Rhamnopyranosylglucosinalbin dan senyawa 4-(4-asetilrhamnosida) selama 10 ns menunjukan nilai RMSD dan RMSF yang rendah dan stabil dibandingkan senyawa pada reseptor reseptor main protease Sars-CoV-2. Dari hasil uji prediksi sintesis senyawa daun kelor, senyawa 4-O-alpha-L-Rhamnopyranosylglucosinalbin dan senyawa 4-(4-asetilrhamnosida dapat di sintesis dengan melihat alur pembuatan dari kemiripan senyawa. diketahui bahwa senyawa yang terkandung dalam daun kelor dapat dijadikan kandidat berpotensi dengan afinitas dan kestabilan yang lebih baik. Kata Kunci : Studi komputasi, Docking, Covid-19, Daun kelor, Reseptor. OLEH : RAHMAT JULIAN 31118130
Download
book
BibTex
Latex, Jabref
cloud_download
Original Resource
url resource Institution
