POTENSI PRIMER BARU UNTUK DETEKSI MOLEKULER Escherichia coli DARI AIR SUMUR DI WILAYAH KLITREN
Total View This Week0
Total View This Week0
Institusion
Universitas Kristen Duta Wacana
Author
31110016, RADEN AJENG MERTHA PRANA
Subject
QH426 Genetics
Datestamp
2020-06-22 22:30:03
Abstract :
Escherichia coli dikenal sebagai bakteri indikator untuk keamanan air minum, kehadiran Escherichia coli sebagai tanda bahwa air tidak aman untuk diminum. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mendeteksi keberadaan E. coli di sumur daerah Klitren, Yogyakarta yang digunakan sebagai air minum. Sampel air sumur dikumpulkan, dan kemudian diolah pada membran ultra filtrasi. Sampel air sumur kemudian diinokulasi pada media selektif E. coli. Diperoleh 81 isolat biru gelap yang diduga E. coli dari media selektif. Kemudian tes biokimia dilakukan untuk memastikan koloni yang diduga sebagai E. coli termasuk uji motilitas, indol dan fermentasi sorbitol, metil merah, tes lisin dekarboksilase dan pertumbuhan pada laktosa broth. Hasil penelitian menunjukkan 27 koloni memberi hasil positif E. coli. Kemudian konfirmasi dilakukan dengan deteksi molekuler menarget gen gyrB dan lacZ. Pasangan primer spesifik yang berasal dari conserved area meliputi gen yang digunakan untuk in silico dan in vitro dalam studi PCR. Analisis ini menghasilkan pasangan primer baru yang spesifik untuk E. coli. Hasil penelitian menunjukkan adanya E. coli dalam sampel sebelum filtrasi dan tidak ditemukan E. coli pada sampel setelah filtrasi. Hasil analisis filogenetik menunjukkan bahwa jenis E. coli adalah Enterohemorrhagic (EHEC), Extraintestinal Pathogenic Escherichia coli (ExPEC), Invasive E. coli (AIEC), dan Shiga Toxin Producing E. coli (STEC).
Escherichia coli dikenal sebagai bakteri indikator untuk keamanan air minum, kehadiran Escherichia coli sebagai tanda bahwa air tidak aman untuk diminum. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mendeteksi keberadaan E. coli di sumur daerah Klitren, Yogyakarta yang digunakan sebagai air minum. Sampel air sumur dikumpulkan, dan kemudian diolah pada membran ultra filtrasi. Sampel air sumur kemudian diinokulasi pada media selektif E. coli. Diperoleh 81 isolat biru gelap yang diduga E. coli dari media selektif. Kemudian tes biokimia dilakukan untuk memastikan koloni yang diduga sebagai E. coli termasuk uji motilitas, indol dan fermentasi sorbitol, metil merah, tes lisin dekarboksilase dan pertumbuhan pada laktosa broth. Hasil penelitian menunjukkan 27 koloni memberi hasil positif E. coli. Kemudian konfirmasi dilakukan dengan deteksi molekuler menarget gen gyrB dan lacZ. Pasangan primer spesifik yang berasal dari conserved area meliputi gen yang digunakan untuk in silico dan in vitro dalam studi PCR. Analisis ini menghasilkan pasangan primer baru yang spesifik untuk E. coli. Hasil penelitian menunjukkan adanya E. coli dalam sampel sebelum filtrasi dan tidak ditemukan E. coli pada sampel setelah filtrasi. Hasil analisis filogenetik menunjukkan bahwa jenis E. coli adalah Enterohemorrhagic (EHEC), Extraintestinal Pathogenic Escherichia coli (ExPEC), Invasive E. coli (AIEC), dan Shiga Toxin Producing E. coli (STEC).
Download
book
BibTex
Latex, Jabref
cloud_download
Original Resource
url resource Institution
