Virtual Screening Berbasis Farmakofor Untuk Identifikasi Senyawa Antikanker Yang Menargetkan Bruton Tirosin Kinase(Btk)
Total View This Week16
Total View This Week16
Institusion
Universitas Halu Oleo
Author
Oktovia Nurmawati, F1C1 15 052
Subject
Virtual Screening
Datestamp
2019-11-11 05:50:55
Abstract :
Virtual Screening Berbasis Farmakofor untuk Indentifikasi Senyawa Antikanker yang Menargetkan Bruton Tirosin Kinase (BTK) OKTOVIA NURMAWATI F1C1 15 052 Abstrak Bruton Tirosin Kinase (BTK) adalah Kinase non-reseptor yang memainkan peran penting dalam pensinyalan onkogenik yang sangat penting untuk proliferasi dan kelangsungan hidup sel-sel leukemia pada keganasan sel B. Sementara itu, aktivasi sel B yang menyimpang dikaitkan dengan pelepasan BTK yang terlibat dalam beberapa jalur sinyal hilir dari reseptor sel B. Dalam penelitian ini, virtual screening berbasis farmakofor dan penambatan molekul digunakan untuk mengidentifikasi ligan (senyawa aktif) sebagai inhibitor BTK. Fitur farmakofor dibangun dengan tujuh ikatan hidrogen akseptor, empat interaksi hidrofobik dan empat ikatan hidrogen donor menggunakan ligan alami 2V3, selanjutnya digunakan untuk menyaring ligan pada basis data Zinc menggunakan Pharmit. Senyawa hit yang diperoleh dilakukan penambatan molekul menggunakan iDock. Dari hasil analisis iDock, diperoleh sepuluh senyawa hit terbaik yang memiliki energi bebas Gibbs (∆G) terendah untuk dilakukan interaksi ligan dengan reseptor. Hasil penelitian menunjukkan lig_56 (∆G= -10,96 kkal/mol) memiliki kemampuan sebanding dengan ligan alami (∆G= -12,62 kkal/mol) dan menghasilkan interaksi ikatan hidrogen pada asam amino lisin yang sama dengan ligan alaminya. Lig_56 berpotensi dijadikan inhibitor BTK Kata kunci: Energi bebas Gibbs, Bruton Tirosin Kinase, penambatan molekul dan virtual screening
Virtual Screening Berbasis Farmakofor untuk Indentifikasi Senyawa Antikanker yang Menargetkan Bruton Tirosin Kinase (BTK) OKTOVIA NURMAWATI F1C1 15 052 Abstrak Bruton Tirosin Kinase (BTK) adalah Kinase non-reseptor yang memainkan peran penting dalam pensinyalan onkogenik yang sangat penting untuk proliferasi dan kelangsungan hidup sel-sel leukemia pada keganasan sel B. Sementara itu, aktivasi sel B yang menyimpang dikaitkan dengan pelepasan BTK yang terlibat dalam beberapa jalur sinyal hilir dari reseptor sel B. Dalam penelitian ini, virtual screening berbasis farmakofor dan penambatan molekul digunakan untuk mengidentifikasi ligan (senyawa aktif) sebagai inhibitor BTK. Fitur farmakofor dibangun dengan tujuh ikatan hidrogen akseptor, empat interaksi hidrofobik dan empat ikatan hidrogen donor menggunakan ligan alami 2V3, selanjutnya digunakan untuk menyaring ligan pada basis data Zinc menggunakan Pharmit. Senyawa hit yang diperoleh dilakukan penambatan molekul menggunakan iDock. Dari hasil analisis iDock, diperoleh sepuluh senyawa hit terbaik yang memiliki energi bebas Gibbs (∆G) terendah untuk dilakukan interaksi ligan dengan reseptor. Hasil penelitian menunjukkan lig_56 (∆G= -10,96 kkal/mol) memiliki kemampuan sebanding dengan ligan alami (∆G= -12,62 kkal/mol) dan menghasilkan interaksi ikatan hidrogen pada asam amino lisin yang sama dengan ligan alaminya. Lig_56 berpotensi dijadikan inhibitor BTK Kata kunci: Energi bebas Gibbs, Bruton Tirosin Kinase, penambatan molekul dan virtual screening
Download
book
BibTex
Latex, Jabref
cloud_download
Original Resource
url resource Institution
