STUDI IN SILICO SENYAWA QUERCETIN TERHADAP
RESEPTOR PLpro, 3CLpro dan NSP3 SEBAGAI
KANDIDAT ANTIVIRUS SARS-CoV-2
Total View This Week0
Total View This Week0
Institusion
Universitas Ngudi Waluyo
Author
Fajrin Kurniapuspa Aryanti, Ika
Susilo, Jatmiko
Susilo, Jatmiko
Subject
RS Pharmacy and materia medica
Datestamp
2021-11-01 04:20:31
Abstract :
Latar Belakang : Pandemi Covid-19 yang terjadi saat ini dapat diklasifikasikan sebagai kondisi kedaruratan atau bencana global dan menyebabkan angka kematian tinggi. Senyawa Quercetin diduga dapat digunakan sebagai antivirus, dengan mencegah sintesis dan replikasi RNA Virus membentuk ikatan dengan protein 3CLpro, PLpro, dan NSP3. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menganalisa potensi Quercetin sebagai inhibitor 3CLpro, PLPro, dan NSP3 pada SARS-CoV-2 melalui molecular docking. Metode : Penelitian eksperimental dilakukan dengan cara analisis in silico melalui sistem komputasi molecular docking terhadap senyawa Quercetin sebagai kandidat antivirus Covid-19 terhadap 3CLpro, PLpro dan NSP3 menggunakan software PLANTS dan YASARA. Hasil : Nilai validasi ligand native RMSD < 2.0 Å pada ketiga protein 3CLpro, PLpro, dan NSP3, dan dihasilkan skor docking ligand native dan senyawa Quersetin terhadap protein pada kode PDB 5R7Y yakni (-62,25±1,52) dan (-70,359±0,31), kode PDB 3E9S yakni (-110,3349±0,48) dan (-79,1542±1,12), serta kode PDB 6WOJ yakni (-136,1779±2,03) dan (-87,3134±0,82). Hasil uji ANNOVA p <0,001 dan Uji Post Hoc p<0,001 yang menunjukkan ada perbedaan skor docking secara signifikan. Kesimpulan : Senyawa Quercetin mampu berikatan dengan asam amino pada protein 3CLpro, PLpro, dan NSP3, dan memiliki perbedaan skor docking diantara ketiganya. Namun ikatan yang lebih poten yaitu senyawa Quercetin dengan protein 3CLpro yang ditunjukkan dengan hasil rata-rata skor docking Quercetin lebih rendah dari ligand native, sehingga dapat dikatakan sebagai kandidat antivirus Covid-19. Kata Kunci : Quercetin, Inhibitor SARS-CoV-2, In Silico Kepustakaan : 39 (1988 ? 2021)
Latar Belakang : Pandemi Covid-19 yang terjadi saat ini dapat diklasifikasikan sebagai kondisi kedaruratan atau bencana global dan menyebabkan angka kematian tinggi. Senyawa Quercetin diduga dapat digunakan sebagai antivirus, dengan mencegah sintesis dan replikasi RNA Virus membentuk ikatan dengan protein 3CLpro, PLpro, dan NSP3. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menganalisa potensi Quercetin sebagai inhibitor 3CLpro, PLPro, dan NSP3 pada SARS-CoV-2 melalui molecular docking. Metode : Penelitian eksperimental dilakukan dengan cara analisis in silico melalui sistem komputasi molecular docking terhadap senyawa Quercetin sebagai kandidat antivirus Covid-19 terhadap 3CLpro, PLpro dan NSP3 menggunakan software PLANTS dan YASARA. Hasil : Nilai validasi ligand native RMSD < 2.0 Å pada ketiga protein 3CLpro, PLpro, dan NSP3, dan dihasilkan skor docking ligand native dan senyawa Quersetin terhadap protein pada kode PDB 5R7Y yakni (-62,25±1,52) dan (-70,359±0,31), kode PDB 3E9S yakni (-110,3349±0,48) dan (-79,1542±1,12), serta kode PDB 6WOJ yakni (-136,1779±2,03) dan (-87,3134±0,82). Hasil uji ANNOVA p <0,001 dan Uji Post Hoc p<0,001 yang menunjukkan ada perbedaan skor docking secara signifikan. Kesimpulan : Senyawa Quercetin mampu berikatan dengan asam amino pada protein 3CLpro, PLpro, dan NSP3, dan memiliki perbedaan skor docking diantara ketiganya. Namun ikatan yang lebih poten yaitu senyawa Quercetin dengan protein 3CLpro yang ditunjukkan dengan hasil rata-rata skor docking Quercetin lebih rendah dari ligand native, sehingga dapat dikatakan sebagai kandidat antivirus Covid-19. Kata Kunci : Quercetin, Inhibitor SARS-CoV-2, In Silico Kepustakaan : 39 (1988 ? 2021)
File :
HALAMAN JUDUL_IKA FAJRIN - Ika Fajrin Kurnia.pdf
HAL PENGESAHAN_ARTIKEL - Ika Fajrin Kurnia.pdf
BAB V_IKA FAJRIN - Ika Fajrin Kurnia.pdf
DAFTAR PUSTAKA_IKA FAJRIN - Ika Fajrin Kurnia.pdf
LAMPIRAN BELAKANNG_IKA FAJRIN - Ika Fajrin Kurnia.pdf
FULL TEXT_SKRIPSI_IKA FAJRIN - Ika Fajrin Kurnia.pdf
ABSTRAK_IKA FAJRIN - Ika Fajrin Kurnia.pdf
LAMPIRAN DEPAN_IKA FAJRIN - Ika Fajrin Kurnia.pdf
ARTIKEL_IKA FAJRIN - Ika Fajrin Kurnia.pdf
BAB I_IKA FAJRIN - Ika Fajrin Kurnia.pdf
BAB II_IKA FAJRIN - Ika Fajrin Kurnia.pdf
BAB III_IKA FAJRIN - Ika Fajrin Kurnia.pdf
BAB IV_IKA FAJRIN - Ika Fajrin Kurnia.pdf
Download
book
BibTex
Latex, Jabref
cloud_download
Original Resource
url resource Institution
