UJI DIAGNOSTIK DESAIN MULTIPLEX PCR BERBASIS VARIASI GENOTIPE COVID-19 PADA ISOLAT LOKAL
Total View This Week0
Total View This Week0
Institusion
Universitas Andalas
Author
Hasna, Mirda Amazan
Subject
Q Science (General)
Datestamp
2022-05-10 03:53:03
Abstract :
ABSTRAK Uji Diagnostik Desain Multiplex PCR Berbasis Variasi Genotipe Covid-19 Pada Isolat Lokal Oleh : Hasna Mirda Amazan (1920312008) Dibawah bimbingan : Dr. dr. Andani Eka Putra, M.Sc dan dr. Rauza Sukma Rita PhD Desain multiplex PCR pada gen ORF1ab dan gen N memiliki sensitivitas dan spesifisitas yang tinggi dalam uji diagnostik terhadap deteksi Covid-19 menggunakan isolat lokal. Tujuan penelitian untuk mengetahui uji diagnostik desain primer dan probe gen ORF1ab dan gen N dalam deteksi Covid-19 menggunakan metode multiplex PCR pada isolat lokal. Desain penelitian berupa deskriptif eksploratif dengan pendekatan cross sectional dimulai dari bulan Mai hingga Desember 2021. Sampel yang digunakan dalam penelitian ini adalah sampel positif sebanyak 60 sampel. Hasil desain primer dan probe gen ORF1ab dengan primer forward: 5?- CGCAATTTACAACACAGAC -3? primer reverse : 5?- GTTCTTTATGCTAGCCACT -3? panjang amplikon 183 bp, dan sekuen probe: FAM 5?-AAACACACAACAGCATCGTCA-3? BHQ-1, pada gen N dengan primer forward: 5?-AATTCAACTCCAGGCAG -3? dan primer reverse : 5?- CTCTCAAGCTGGTTCAATC -3? panjang amplikon 111 bp, dan sekuens probe: HEX 5?-CAGCAAAGCAAGAGCAGCA-3? BHQ-1. Hasil uji dimasukan kedalam tabel 2x2 dalam rumus uji diagnostik. Hasil penelitian desain multiplex PCR gen ORF1ab dan gen N, diperoleh uji diagnostik dengan sensitivitas 98.95 %, spesifisitas 96.15 % dengan nilai prediksi positif 98.95% dan nilai prediksi negatif mencapai 96.15%. Kesimpulan penelitian ini, hasil uji diagnostik desain multiplex PCR pada gen ORF1ab dan gen N dapat digunakan sebagai kandidat primer dan probe dalam deteksi Covid 19. Kata kunci : Covid-19, RT-PCR, Primer dan Probe Gen ORF1ab, Gen N
ABSTRAK Uji Diagnostik Desain Multiplex PCR Berbasis Variasi Genotipe Covid-19 Pada Isolat Lokal Oleh : Hasna Mirda Amazan (1920312008) Dibawah bimbingan : Dr. dr. Andani Eka Putra, M.Sc dan dr. Rauza Sukma Rita PhD Desain multiplex PCR pada gen ORF1ab dan gen N memiliki sensitivitas dan spesifisitas yang tinggi dalam uji diagnostik terhadap deteksi Covid-19 menggunakan isolat lokal. Tujuan penelitian untuk mengetahui uji diagnostik desain primer dan probe gen ORF1ab dan gen N dalam deteksi Covid-19 menggunakan metode multiplex PCR pada isolat lokal. Desain penelitian berupa deskriptif eksploratif dengan pendekatan cross sectional dimulai dari bulan Mai hingga Desember 2021. Sampel yang digunakan dalam penelitian ini adalah sampel positif sebanyak 60 sampel. Hasil desain primer dan probe gen ORF1ab dengan primer forward: 5?- CGCAATTTACAACACAGAC -3? primer reverse : 5?- GTTCTTTATGCTAGCCACT -3? panjang amplikon 183 bp, dan sekuen probe: FAM 5?-AAACACACAACAGCATCGTCA-3? BHQ-1, pada gen N dengan primer forward: 5?-AATTCAACTCCAGGCAG -3? dan primer reverse : 5?- CTCTCAAGCTGGTTCAATC -3? panjang amplikon 111 bp, dan sekuens probe: HEX 5?-CAGCAAAGCAAGAGCAGCA-3? BHQ-1. Hasil uji dimasukan kedalam tabel 2x2 dalam rumus uji diagnostik. Hasil penelitian desain multiplex PCR gen ORF1ab dan gen N, diperoleh uji diagnostik dengan sensitivitas 98.95 %, spesifisitas 96.15 % dengan nilai prediksi positif 98.95% dan nilai prediksi negatif mencapai 96.15%. Kesimpulan penelitian ini, hasil uji diagnostik desain multiplex PCR pada gen ORF1ab dan gen N dapat digunakan sebagai kandidat primer dan probe dalam deteksi Covid 19. Kata kunci : Covid-19, RT-PCR, Primer dan Probe Gen ORF1ab, Gen N
Download
book
BibTex
Latex, Jabref
cloud_download
Original Resource
url resource Institution
